体育祭は、毎年5月下旬に、医学科と看護学科の共同行事として行われます。学生が中心となって企画・運営し、チーム対抗の競技を通じて人間関係も深まります。一番盛り上がる競技は騎馬戦で、毎回白熱した闘いが繰り広げられます。

並木祭は、毎年10月に行われる防衛医科大学校の一大イベントです。学生による実行委員会が組織され、開催します。講演会やライブ、学生による演奏会、模擬店などに加え、医学研究セミナーや看護研究展示など日頃の学習の成果を発表する場でもあります。